اخیراً گزارش برخی موارد خطا در نتایج منفی آزمایش اچ- آی- وی منجر به نگرانی پزشکان و بیماران شده است. بر اساس دستورالعمل کلی، نمونه خون همه بیمارانی که آزمایش اولیه غربالگری اچ- آی- وی ( ویروس ایدز ) در آنان مثبت باشد باید جهت تأیید به مراکزی ارسال شود که آزمایش وسترن بلات انجام می دهند. واقعیت این است که آزمایش های اولیه غربالگری قادر به تشخیص زودرس اچ- آی- وی هستند ولی به ندرت ممکن است بیماری های دیگر مانند سرماخوردگی یا حتی تزریق واکسن آنفلوانزا باعث شوند نتایج به صورت کاذب مثبت شوند. تنها مزیت آزمایش غربالگری، تشخیص زودرس عفونت اچ- آی- وی است. از سوی دیگر، نتایج مثبت آزمایش وسترن بلات کاملاً قابل اعتماد است ولی نتایج منفی متأسفانه ممکن است گمراه کننده باشند. بیشترین محدودیت وسترن بلات در تشخیص زودرس اچ- آی- وی در 40 روز اول پس از آلودگی و ابتلا به عفونت است. چهل روز برای فردی که از وضعیت خود مطلع نباشد زمان بسیار زیادی است به ویژه که عفونت اچ- آی- وی طی این دوره ابتدایی به شدت سرایت پذیر است. پژوهشگران توصیه می کنند برای پرهیز از مشکلات احتمالی، حداقل در موارد مشکوک، نتایج منفی وسترن بلات حتماً با روش جدیدتر اندازه گیری بار ویروس تأیید شوند.